迷失岛2在核心玩法上延续了前作的解谜探索机制，但通过新增的时间机器、二周目设计及随机谜题系统，显著提升了游戏的可玩性与叙事深度。灰烬轮船任务作为关键剧情节点，要求玩家在时间限制内完成物资筹备、线索收集、解谜战斗等复合挑战，其多线程设计比原版单一线性流程更具策略性。游戏还引入工厂解密、灯塔电路修复等新场景谜题，需结合物理互动与逻辑推理，难度曲线更为平滑。
迷失岛2采用更精细的手绘风格，将宗教符号、外星元素与科幻装置融合，如火箭发射台、神庙石像等场景的细节刻画远超原版。黑板公式、漂流瓶图案等线索设计也强化了视觉叙事，玩家需通过截图或内置画板记录关键信息，这种动态记录方式取代了原版静态笔记功能。
谜题机制上，本作通过随机初始化技术使华容道、一笔连线等小游戏每次开局不同，杜绝依赖攻略的可能。例如灯塔电线修复需根据九宫格反射板实时调整线路，工厂密码锁需结合外星人线索动态破译。这种设计迫使玩家深入理解谜题逻辑，而非简单复现原版固定解法。
叙事层面，迷失岛2通过时间穿越构建多重视角。玩家需在过去与现在切换，利用时空悖论解开石室拼图、获取曼陀罗花等关键道具。二周目新增的三角异形块与隐藏成就，进一步揭示时间循环背后的真相，这种非线性的叙事结构比原版单结局更具探索价值。
操作优化方面，游戏新增自动存档、难度分级功能，并简化了物品交互逻辑。如鲸鱼解剖、八音盒调试等环节减少冗余步骤，使玩家更聚焦于核心解谜。协作任务中NPC提示更精准，避免原版因模糊指引导致的卡关问题。这些改动在保留硬核解谜内核的同时，提升了整体流畅度。
